Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TM4SF1P30408 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TM4SF1P30408 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms