Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5AP29375 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5AP29375 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms