Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
APCP25054 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
APCP25054 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APCP25054 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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