Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KDELR1P24390 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms