Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP11P24347 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MMP11P24347 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP11P24347 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP11P24347 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP11P24347 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP11P24347 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MMP11P24347 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MMP11P24347 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP11P24347 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP11P24347 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP11P24347 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP11P24347 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MMP11P24347 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms