Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA5P20719 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms