Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREB1P16220 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREB1P16220 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms