Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD8P13378 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms