Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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