Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRPRAP08240 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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