Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POP4O95707 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POP4O95707 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POP4O95707 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POP4O95707 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POP4O95707 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POP4O95707 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms