Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms