Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLX3O43711 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLX3O43711 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TLX3O43711 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TLX3O43711 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms