Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms