Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-1B6SEH8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms