Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIT2A6NDA9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms