Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC162PA2VCL2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms