Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms