Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SORCS3Q9UPU3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms