Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD1BQ9UPS6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD1BQ9UPS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms