Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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