Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP35Q9P2H5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP35Q9P2H5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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