Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRBP1Q9P2E9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRBP1Q9P2E9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms