Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM27Q9HBJ8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms