Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms