Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ROPN1BQ9BZX4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ROPN1BQ9BZX4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms