Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM8Q9BZR9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms