Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIFKQ9BYG3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIFKQ9BYG3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms