Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPERQ9BY12 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAPERQ9BY12 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms