Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPATA16Q9BXB7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms