Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms