Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms