Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms