Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAT1Q99536 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms