Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYNGAP1Q96PV0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms