Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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