Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTHRC1Q96CG8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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