Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms