Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP3Q6NUK4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms