Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC27Q2M243 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms