Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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