Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCOLCEQ15113 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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