Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EBI3Q14213 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms