Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL4A6Q14031 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms