Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms