Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL3Q13618 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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