Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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