Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF5Q13243 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms