Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXF1Q12946 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXF1Q12946 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXF1Q12946 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FOXF1Q12946 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF1Q12946 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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