Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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